Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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