Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms