Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms