Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms