Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms