Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms