Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms