Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms