Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms