Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfebQ9R210 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms