Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf7Q9R1C0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf7Q9R1C0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf7Q9R1C0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf7Q9R1C0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf7Q9R1C0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf7Q9R1C0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf7Q9R1C0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf7Q9R1C0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf7Q9R1C0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms