Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt71Q9R0H5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms