Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nek3Q9R0A5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nek3Q9R0A5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nek3Q9R0A5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms