Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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