Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms