Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pkp3Q9QY23 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pkp3Q9QY23 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pkp3Q9QY23 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pkp3Q9QY23 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pkp3Q9QY23 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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