Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms