Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms