Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms