Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms