Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms