Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rfx5Q9JL61 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rfx5Q9JL61 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rfx5Q9JL61 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rfx5Q9JL61 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rfx5Q9JL61 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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