Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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