Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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