Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga3Q9JJZ8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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