Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LratQ9JI60 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LratQ9JI60 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LratQ9JI60 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LratQ9JI60 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LratQ9JI60 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LratQ9JI60 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LratQ9JI60 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LratQ9JI60 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LratQ9JI60 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LratQ9JI60 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms