Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim39Q9ESN2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trim39Q9ESN2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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