Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rtn3Q9ES97 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rtn3Q9ES97 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rtn3Q9ES97 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rtn3Q9ES97 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rtn3Q9ES97 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rtn3Q9ES97 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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