Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Stx12Q9ER00 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Stx12Q9ER00 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Stx12Q9ER00 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Stx12Q9ER00 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Stx12Q9ER00 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms