Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms