Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmgn3Q9DCB1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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