Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms