Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms