Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn23Q9D7D7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms