Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms