Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4f1Q9D5Q6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms