Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms