Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1cQ9D300 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms