Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms