Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms