Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYX7

Rrp15, RRP15-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp15Q9CYX7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp15Q9CYX7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp15Q9CYX7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp15Q9CYX7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp15Q9CYX7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp15Q9CYX7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp15Q9CYX7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp15Q9CYX7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp15Q9CYX7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp15Q9CYX7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp15Q9CYX7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp15Q9CYX7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rrp15Q9CYX7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rrp15Q9CYX7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rrp15Q9CYX7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp15Q9CYX7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms