Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp8Q9CY28 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms