Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms