Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms