Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms