Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Atp6v0e1Q9CQD8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Atp6v0e1Q9CQD8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Atp6v0e1Q9CQD8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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