Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Rnaseh2cQ9CQ18 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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