Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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