Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms