Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms